Struktur organisasi SMP Negeri 2 Kendal umumnya terdiri dari beberapa komponen berikut:
- Kepala Sekolah: Memimpin dan mengelola seluruh kegiatan sekolah.
- Wakil Kepala Sekolah:
- Wakil Kepala Sekolah Bidang Kurikulum
- Wakil Kepala Sekolah Bidang Kesiswaan
- Wakil Kepala Sekolah Bidang Sarana dan Prasarana
- Guru: Terdiri dari guru-guru yang mengajar berbagai mata pelajaran.
- Staf Administrasi: Mengelola administrasi sekolah, termasuk keuangan, data siswa, dan dokumen lainnya.
- Bidan Layanan: Tenaga pengajar yang memberikan layanan bimbingan konseling untuk siswa.
- Organisasi Siswa: Seperti OSIS, yang berfungsi untuk menampung aspirasi siswa dan mengembangkan keterampilan kepemimpinan.